تنها خدا کافیست

خاطرات خیلی عجیبند، گاهی اوقات می خندیم ، به روزهایی که گریه میکردیم ! گاهی گریه میکنیم ، به یاد روزهایی که میخندیدیم

تنها خدا کافیست

خاطرات خیلی عجیبند، گاهی اوقات می خندیم ، به روزهایی که گریه میکردیم ! گاهی گریه میکنیم ، به یاد روزهایی که میخندیدیم

تنها خدا کافیست

این وبلاگ شخصی ، سید سجاد موسوی نژاد سوق است ، تمام مطالب برگرفته از نوشته های شخصی اینجانب می باشد مگر انکه منبع مطلب ذکر شده باشد یا خیلی خیلی تابلو باشد!

دنبال کنندگان ۵ نفر
این وبلاگ را دنبال کنید

نصب نرم افزار lammps در اوبونتو

دوشنبه, ۱۱ بهمن ۱۳۹۵، ۱۰:۰۲ ق.ظ

lammps

با سلام خدمت دوستان عزیز

در این پست به چگونگی نصب و اجرای برنامه لمپس می پردازیم. نرم افزار لمپس یک کد محاسباتی برای حل سیستم های اتمی بزرگ می باشد. در سیستم عامل اوبونتو برای نصب آن باید مراحل زیر را اجرا کنید:

lمرحله اول اضافه کردن مخزن لمپس به مخازن سیستم است:


sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps


سپس لازم دستورات زیر را به ترتیب اجرا کنید


sudo apt-get update
sudo apt-get install lammps-daily


 پس از دانلود و نصب فایل ها . لازم است برای اجرای موازی نیز سیستم را اماده کنیم. برای این منظور ابتدا لازم است نرم افزار openmpi نصب شود برای این منظور کد های زیر را در تریمنال وارد کنید:


sudo apt-get install mpi-default-bin mpi-default-dev


سپس در ترمینال کد زیر را وارد کنید. توجه شود که در کد زیر مقدار N تعداد هسته های سیستم شما م یباشد. (بین عدد و علامت مساوی نباید فاصله ای باشد)


echo "export  OMP_NUM_THREADS=N" >> $HOME/.profile


حال سیستم برای اجرای یک مثال اماده است . برای استفاده از حالت سری بصورت زیر فایل ورودی را در لمپس اجرا می کنیم:


lammps-daily < inputfile


 و برای حالت موازی بصورت زیر (در کد زیر به جای عدد نوشته شده تعداد هسته های که برای اجرا می خواهید را وارد کنید کمتر یا مساوی کل تعداد هسته هایی که قبلا برای سیستم تعریف کرده ایم - دو خط بالاتر)

mpirun -np 2 lammps-daily < inputfile



  • سجاد موسوی نژاد سوق

MD

lammps

ubuntu

لمپس

نظرات (۱)

نفهمیدیم 
باتشکر :))
پاسخ:
خیلی جالب بود.

ارسال نظر آزاد است، اما اگر قبلا در بیان ثبت نام کرده اید می توانید ابتدا وارد شوید.
شما میتوانید از این تگهای html استفاده کنید:
<b> یا <strong>، <em> یا <i>، <u>، <strike> یا <s>، <sup>، <sub>، <blockquote>، <code>، <pre>، <hr>، <br>، <p>، <a href="" title="">، <span style="">، <div align="">
تجدید کد امنیتی